新生儿一出生就要接种的疫苗有两种，一为卡介苗，二为乙肝疫苗。
接种卡介苗能增强孩子对结核病的抵抗能力，是预防结核病的有效措施。近年来世界上结核病有抬头的趋势，而婴儿由于免疫系统尚不完善，一旦感染极易扩散。
新生儿接种卡介苗应在出生后24小时进行，采用皮内注射法。一般接种后2～3天局部发红，2～3周形成红肿硬块，中间部位逐渐软化形成小脓疱，破溃后留有疤痕，称之为“卡疤”。3个月后，孩子要到当地结核病防治所去检查卡介苗接种是否成功。如果结核菌素试验呈阴性，说明接种不成功，要及时补种。有的新生儿由于各种原因出生时未能及时接种卡介苗，应争取在3个月内尽早接种；如果超过3个月则要先做结核菌素实验，确定未被结核感染才可补种卡介苗。
新生儿出生24小时内还应接种乙肝疫苗。满30～56天接种第二针，6～8个月(不超过10个月)接种第三针。这就是被称为“0、1、6”的接种时间程序。及早接种乙肝疫苗可阻断母婴间乙型肝炎的垂直传播。凡符合条件者均应接种。
注射乙肝疫苗是为了预防乙型肝炎。目前多采用的是重组酵母乙肝疫苗，即用基因工程技术将乙型肝炎表面抗原的基因片段重组、纯化制成的死疫苗。如果孩子发热、正患急慢性严重疾病、有过敏史的，均应暂缓或禁止接种；如果孩子有严重黄疸或肝脏疾病(肝炎)，也应暂缓接种。何时接种由医生检查后决定。接种后一般反应轻微。
