造成中枢神经系统、大脑、下丘脑、脑垂体的疾病或受某些因素影响时也会造成闭经，尤其是下丘脑和脑垂体的功能失调或疾病均可引起闭经，例如脑膜炎、脑炎、脑损伤、放射治疗、脑肿瘤等都会引起。一些闭经者的乳房在非怀孕生育期有流乳汁现象，称为闭经一溢乳综合征。一般来说，在这些情况下，脑部疾病往往有比较明显的其他症状，闭经可能是次要的症状了。
3.卵巢功能受影响造成闭经。
月经的发生、启动主要是卵巢分泌的雌孕激素作用完成的，因此影响卵巢正常功能的情况都可能造成闭经，如卵巢早衰、卵巢组织受损(手术、放射治疗、严重感染等)、卵巢肿瘤、多囊卵巢综合征等均可造成闭经。对有闲经的妇女找出病因就显得更为重要了。
4.肾上腺病变造成闭经。
这主要是由于肾上腺皮质分泌性激素，并且以雄激素为主，它的功能受影响就会造成卵巢功能异常而发生间经。
5.甲状腺功能改变造成闭经。
有甲亢和甲状腺功能减退的妇女会通过对全身新陈代谢的影响，以及对中枢神经系统的影响而造成闭经。
6.子宫疾病造成闭经。
既然月经血是在子宫中产生的，凡是造成子宫病变的情况多可造成闭经。当子宫内膜受到严重损坏(如刮宫、感染)以及过久哺乳时均有可能发生闭经。
7.他情况发生闭经。
少数妇女使用避孕药后可发生闭经，但停药后月经就会恢复。
