然而女性在怀孕时，阴道酸碱度会失衡，免疫力下降，病菌侵袭，原来的有益菌也会成为致病菌大肆繁殖，并发感染，造成炎症。而孕育胎儿的子宫又通过宫颈管与阴道相通，如果人工流产手术前不进行必要的检查治疗，就可能把致病菌直接带入宫腔，导致产生各种炎症。比如子宫内膜炎等，病人可能出现高热、腹痛，严重的也可能危及生命。
当然，也有些病人认为，只要术后用抗生素抗炎治疗就没有问题了。但人流手术后，全身和阴道局部免疫力都会下降，阴道环境更是被破坏了，如果病人再不能保证足够的休息和调养，抗生素的抗菌效果会受到很大影响，何况没有一种抗生素是万能的，术后感染如附件炎、盆腔炎等炎症的可能性还是很大。所以人流前如果患有阴道炎等其他疾病，一定要先消炎、杀菌，然后才能行人流手术。
